Departemen Francisco Morazán merupakan sebuah departemen di Honduras. Departemen ini memiliki luas wilayah 7.946 km² dengan memiliki jumlah penduduk sebanyak 1.680.700 jiwa (2005). Departemen ini beribu kota di Francisco Morazán. Didirikan tahun 1943. Departemen ini terbagi menjadi 28 munisipalitas.